กลุ่มวิจัยความหลากหลายทางชีวภาพสัตว์น้ำจืด มีหน้าที่ที่รับผิดชอบ
(1) ศึกษา ค้นคว้า วิจัย สถานภาพ ชีวประวัติ และความหลากหลายทางชีวภาพทั้งในระดับชนิด และ พันธุกรรมของสัตว์ และพืชน้ำจืดในระบบแม่น้ำ และพื้นที่ชุ่มน้ำ      
(2) สํารวจ รวบรวม เก็บรักษา จัดหมวดหมู่ ลงทะเบียนตัวอย่างสัตว์น้ำจืด ในรูปของพิพิธภัณฑ์ตัวอย่างดอง และธนาคารดีเอ็นเอ เพื่อใช้เป็นตัวอย่างอ้างอิงของประเทศ รวมทั้งแลกเปลี่ยนตัวอย่างเพื่องานวิจัยและการ อ้างอิงกับพิพิธภัณฑ์หรือสถาบันต่างๆ ทั้งในและต่างประเทศภายใต้ระบบสากลตามหลักการพิพิธภัณฑ์ ธรรมชาติวิทยา     
(3) วิเคราะห์ และจัดทําข้อมูลชีวสารสนเทศของสัตว์น้ำ เพื่อประโยชน์ในการอนุรักษ์พันธุ์สัตว์น้ำ และการ อ้างสิทธิการเป็นเจ้าของทรัพยากร/พันธุกรรมสัตว์น้ำที่นําไปสู่การรับรองทรัพย์สินทางปัญญา     
(4) ตรวจสอบชนิด/สายพันธุ์สัตว์และพืชน้ำจืด เพื่อรับรองความถูกต้องตามหลักวิชาการ     
(5) ให้บริการทางวิชาการ ถ่ายทอดและเผยแพร่ความรู้ด้านความหลากหลายทางชีวภาพสัตว์น้ำจืด     
(6) ปฏิบัติงานร่วมกับหรือสนับสนุนการปฏิบัติงานของหน่วยงานอื่นที่เกี่ยวข้องหรือที่ได้รับมอบหมายกลุ่มวิจัยความหลากหลายทางชีวภาพสัตว์น้ำจืด มีหน้าที่ที่รับผิดชอบ