กองพัฒนาระบบการรับรองมาตรฐานสินค้าประมงและหลักฐานเพื่อการสืบค้น
กองวิจัยและพัฒนาอาหารสัตว์น้ำ
สำนักงานเลขานุการกรม
กองวิจัยและพัฒนาการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำจืด
ศูนย์เทคโนโลยีสารสนเทศและการสื่อสาร
กองกฎหมาย
กองวิจัยและพัฒนาการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำชายฝั่ง
สำนักงานประมงพื้นที่กรุงเทพมหานคร
กองบริหารการคลัง
กองบริหารทรัพยากรบุคคล
กองนโยบายและแผนพัฒนาการประมง
กองวิจัยและพัฒนาเทคโนโลยีอุตสาหกรรมสัตว์น้ำ
กองตรวจราชการ กรมประมง
กองตรวจสอบเรือประมง สินค้าสัตว์น้ำและปัจจัยการผลิต
กองบริหารจัดการเรือประมงและการทำการประมง
กองวิจัยและพัฒนาประมงน้ำจืด
กลุ่มตรวจสอบภายใน
กองตรวจการประมง
กองบริหารจัดการทรัพยากรและกำหนดมาตรการ
กองวิจัยและพัฒนาประมงทะเล
กลุ่มพัฒนาระบบบริหาร
กองโครงการอันเนื่องมาจากพระราชดำริและกิจกรรมพิเศษ
สหกรณ์ออมทรัพย์กรมประมง
กองประมงต่างประเทศ
กองวิจัยและพัฒนาพันธุกรรมสัตว์น้ำ
คณะกรรมการบริหารเงินทุนหมุนเวียนในการผลิตพันธุ์ปลา พันธุ์กุ้ง และพันธุ์สัตว์น้ำอื่นๆ
กองตรวจสอบคุณภาพสินค้าประมง
กองยุทธศาสตร์และแผนงาน
กองวิจัยและพัฒนาสุขภาพสัตว์น้ำ
แยกตามกลุ่มงาน
สำนักงานประมงจังหวัด
ศูนย์วิจัยและพัฒนาพันธุกรรมสัตว์น้ำ
ศูนย์วิจัยและพัฒนาการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำจืด
ศูนย์วิจัยและพัฒนาเทคโนโลยีอาหารสัตว์น้ำ
ศูนย์ป้องกันและปราบปรามทะเล/น้ำจืด
ศูนย์วิจัยและพัฒนาสุขภาพสัตว์น้ำ
ศูนย์วิจัยและพัฒนาประมงน้ำจืด
ศูนย์วิจัยและพัฒนาประมงทะเล
ศูนย์วิจัยและพัฒนาการเพาะเลี้ยงชายฝั่ง
ด่านตรวจประมง
ศูนย์วิจัยและตรวจสอบคุณภาพสินค้าประมง