กองบริหารทรัพยากรบุคคล
กองวิจัยและพัฒนาการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำชายฝั่ง
สำนักงานประมงพื้นที่กรุงเทพมหานคร
กองตรวจสอบเรือประมง สินค้าสัตว์น้ำและปัจจัยการผลิต
กองบริหารจัดการทรัพยากรและกำหนดมาตรการ
กองวิจัยและพัฒนาประมงทะเล
กลุ่มพัฒนาระบบบริหาร
กองตรวจการประมง
กองบริหารจัดการเรือประมงและการทำการประมง
กองวิจัยและพัฒนาประมงน้ำจืด
กลุ่มตรวจสอบภายใน
สหกรณ์ออมทรัพย์กรมประมง
กองตรวจสอบคุณภาพสินค้าประมง
แยกตามกลุ่มงาน
กองประมงต่างประเทศ
กองวิจัยและพัฒนาพันธุกรรมสัตว์น้ำ
คณะกรรมการบริหารเงินทุนหมุนเวียนในการผลิตพันธุ์ปลา พันธุ์กุ้ง และพันธุ์สัตว์น้ำอื่นๆ
กองยุทธศาสตร์และแผนงาน
กองวิจัยและพัฒนาสุขภาพสัตว์น้ำ
กองพัฒนาระบบการรับรองมาตรฐานสินค้าประมงและหลักฐานเพื่อการสืบค้น
กองวิจัยและพัฒนาอาหารสัตว์น้ำ
สำนักงานเลขานุการกรม
กองนโยบายและแผนพัฒนาการประมง
กองวิจัยและพัฒนาเทคโนโลยีอุตสาหกรรมสัตว์น้ำ
กองตรวจราชการ กรมประมง
กองโครงการอันเนื่องมาจากพระราชดำริและกิจกรรมพิเศษ
กองวิจัยและพัฒนาการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำจืด
ศูนย์เทคโนโลยีสารสนเทศและการสื่อสาร
กองกฎหมาย
กองบริหารการคลัง
ศูนย์วิจัยและพัฒนาการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำจืด
ศูนย์วิจัยและพัฒนาประมงน้ำจืด
ศูนย์ป้องกันและปราบปรามทะเล/น้ำจืด
ศูนย์วิจัยและพัฒนาการเพาะเลี้ยงชายฝั่ง
ศูนย์วิจัยและตรวจสอบคุณภาพสินค้าประมง
ด่านตรวจประมง
ศูนย์วิจัยและพัฒนาประมงทะเล
ศูนย์วิจัยและพัฒนาพันธุกรรมสัตว์น้ำ
ศูนย์วิจัยและพัฒนาสุขภาพสัตว์น้ำ
สำนักงานประมงจังหวัด
ศูนย์วิจัยและพัฒนาเทคโนโลยีอาหารสัตว์น้ำ