กองนโยบายและแผนพัฒนาการประมง
กองวิจัยและพัฒนาเทคโนโลยีอุตสาหกรรมสัตว์น้ำ
กองตรวจราชการ กรมประมง
แยกตามกลุ่มงาน
สำนักงานเลขานุการกรม
กองบริหารจัดการทรัพยากรและกำหนดมาตรการ
กองวิจัยและพัฒนาประมงทะเล
กลุ่มพัฒนาระบบบริหาร
กองบริหารทรัพยากรบุคคล
กองตรวจสอบเรือประมง สินค้าสัตว์น้ำและปัจจัยการผลิต
กองประมงต่างประเทศ
กองวิจัยและพัฒนาพันธุกรรมสัตว์น้ำ
คณะกรรมการบริหารเงินทุนหมุนเวียนในการผลิตพันธุ์ปลา พันธุ์กุ้ง และพันธุ์สัตว์น้ำอื่นๆ
สหกรณ์ออมทรัพย์กรมประมง
กองโครงการอันเนื่องมาจากพระราชดำริและกิจกรรมพิเศษ
กองยุทธศาสตร์และแผนงาน
กองวิจัยและพัฒนาสุขภาพสัตว์น้ำ
กองตรวจการประมง
กองพัฒนาระบบการรับรองมาตรฐานสินค้าประมงและหลักฐานเพื่อการสืบค้น
กองวิจัยและพัฒนาอาหารสัตว์น้ำ
กองวิจัยและพัฒนาการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำชายฝั่ง
สำนักงานประมงพื้นที่กรุงเทพมหานคร
กองกฎหมาย
กองบริหารการคลัง
กองบริหารจัดการเรือประมงและการทำการประมง
กองวิจัยและพัฒนาประมงน้ำจืด
กลุ่มตรวจสอบภายใน
กองตรวจสอบคุณภาพสินค้าประมง
กองวิจัยและพัฒนาการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำจืด
ศูนย์เทคโนโลยีสารสนเทศและการสื่อสาร
ศูนย์วิจัยและพัฒนาพันธุกรรมสัตว์น้ำ
สำนักงานประมงจังหวัด
ศูนย์วิจัยและพัฒนาเทคโนโลยีอาหารสัตว์น้ำ
ศูนย์วิจัยและพัฒนาการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำจืด
ศูนย์วิจัยและพัฒนาสุขภาพสัตว์น้ำ
ด่านตรวจประมง
ศูนย์ป้องกันและปราบปรามทะเล/น้ำจืด
ศูนย์วิจัยและพัฒนาการเพาะเลี้ยงชายฝั่ง
ศูนย์วิจัยและตรวจสอบคุณภาพสินค้าประมง
ศูนย์วิจัยและพัฒนาประมงน้ำจืด
ศูนย์วิจัยและพัฒนาประมงทะเล