สำนักงานเลขานุการกรม
กองกฎหมาย
กองบริหารทรัพยากรบุคคล
กองบริหารการคลัง
กองตรวจสอบเรือประมง สินค้าสัตว์น้ำและปัจจัยการผลิต
กองโครงการอันเนื่องมาจากพระราชดำริและกิจกรรมพิเศษ
กองตรวจการประมง
กองตรวจสอบคุณภาพสินค้าประมง
กองนโยบายและแผนพัฒนาการประมง
กองบริหารจัดการทรัพยากรและกำหนดมาตรการ
กองบริหารจัดการเรือประมงและการทำการประมง
กองประมงต่างประเทศ
กองยุทธศาสตร์และแผนงาน
กองพัฒนาระบบการรับรองมาตรฐานสินค้าประมงและหลักฐานเพื่อการสืบค้น
กองวิจัยและพัฒนาการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำจืด
กองวิจัยและพัฒนาการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำชายฝั่ง
กองวิจัยและพัฒนาเทคโนโลยีอุตสาหกรรมสัตว์น้ำ
กองวิจัยและพัฒนาประมงทะเล
กองวิจัยและพัฒนาประมงน้ำจืด
กองวิจัยและพัฒนาพันธุกรรมสัตว์น้ำ
กองวิจัยและพัฒนาสุขภาพสัตว์น้ำ
กองวิจัยและพัฒนาอาหารสัตว์น้ำ
ศูนย์เทคโนโลยีสารสนเทศและการสื่อสาร
สำนักงานประมงพื้นที่กรุงเทพมหานคร
กองตรวจราชการ
กลุ่มพัฒนาระบบบริหาร
กลุ่มตรวจสอบภายใน
สำนักงานเลขานุการคณะกรรมการบริหารเงินทุนหมุนเวียนในการผลิตพันธุ์ปลา พันธุ์กุ้ง และพันธุ์สัตว์น้ำอื่นๆ
สหกรณ์ออมทรัพย์กรมประมง
แยกตามกลุ่มงาน
สำนักงานประมงจังหวัด
ศูนย์วิจัยและพัฒนาการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำจืด
ศูนย์ป้องกันและปราบปรามทะเล/น้ำจืด
ศูนย์วิจัยและตรวจสอบคุณภาพสินค้าประมง
ศูนย์วิจัยและพัฒนาประมงน้ำจืด
ศูนย์วิจัยและพัฒนาการเพาะเลี้ยงชายฝั่ง
ด่านตรวจประมง
ศูนย์วิจัยและพัฒนาประมงทะเล
ศูนย์วิจัยและพัฒนาพันธุกรรมสัตว์น้ำ
ศูนย์วิจัยและพัฒนาเทคโนโลยีอาหารสัตว์น้ำ
ศูนย์วิจัยและพัฒนาสุขภาพสัตว์น้ำ