- 1. ราชการบริหารส่วนกลาง
- กองตรวจราชการ
- กลุ่มพัฒนาระบบบริหาร
- กลุ่มตรวจสอบภายใน
- 2. สำนักงานเลขานุการกรม
- กลุ่มเผยเเพร่และประชาสัมพันธ์
- ห้องสมุด กรมประมง
- กลุ่มเทคโนโลยีโสตทัศนูปกรณ์และสื่อสิ่งพิมพ์
- วารสารการประมง
- 3. กองกฎหมาย
- 4. กองบริหารทรัพยากรบุคคล
- 5. กองบริหารการคลัง
- 6. กองตรวจสอบเรือประมง สินค้าสัตว์น้ำและปัจจัยการผลิต
- ฝ่ายบริหารทั่วไป
- กลุ่มควบคุมการนำเข้าส่งออกสัตว์น้ำและปัจจัยการผลิต
- กลุ่มควบคุมเรือประมงและสินค้าประมงต่างประเทศ
- กลุ่มสารวัตรและกักกันสัตว์น้ำ
- 7. กองโครงการอันเนื่องมาจากพระราชดำริและกิจกรรมพิเศษ
- ฝ่ายบริหารทั่วไป
- กลุ่มวิจัยและพัฒนาการถ่ายทอดเทคโนโลยีการประมง
- กลุ่มโครงการอันเนื่องมาจากพระราชดำริ
- กลุ่มช่วยเหลือเกษตรกรและชาวประมง
- 8. กองตรวจการประมง
- กลุ่มแผนงานและติดตามการตรวจการประมง
- กลุ่มส่งเสริมการมีส่วนร่วมด้านการประมง
- กลุ่มพัฒนาเทคโนโลยีเรือตรวจการณ์ประมง
- 9. กองตรวจสอบคุณภาพสินค้าประมง (เว็บใหม่)
- 10. กองนโยบายและแผนพัฒนาการประมง
- ฝ่ายบริหารงานทั่วไป
- กลุ่มแผนและติดตามยุทธศาสตร์การประมง
- กลุ่มเลขานุการคณะกรรมการนโยบายประมงแห่งชาติ
- กลุ่มวิเคราะห์การค้าสินค้าประมงระหว่างประเทศ
- กลุ่มวิจัยและวิเคราะห์สถิติการประมง
- กลุ่มเศรษฐกิจการประมง
- 11. กองบริหารจัดการทรัพยากรและกำหนดมาตรการ
- 12. กองบริหารจัดการเรือประมงและการทำการประมง
- 13. กองประมงต่างประเทศ
- 14. กองยุทธศาสตร์และแผนงาน
- 15. กองพัฒนาระบบการรับรองมาตรฐานสินค้าประมงและหลักฐานเพื่อการสืบค้น
- 16. กองวิจัยและพัฒนาการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำจืด
- 17. กองวิจัยและพัฒนาการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำชายฝั่ง
- 18. กองวิจัยและพัฒนาเทคโนโลยีอุตสาหกรรมสัตว์น้ำ
- 19. กองวิจัยและพัฒนาประมงทะเล
- ฝ่ายบริหารทั่วไป
- กลุ่มประเมินสภาวะทรัพยากรประมง
- กลุ่มตรวจสอบและรับรองแหล่งประมง
- กลุ่มพัฒนาและฟื้นฟูแหล่งประมง
- กลุ่มพัฒนาเทคโนโลยีประมง
- 20. กองวิจัยและพัฒนาประมงน้ำจืด
- ฝ่ายบริหารทั่วไป
- กลุ่มวิจัยและพัฒนาสถานแสดงพันธุ์สัตว์น้ำจืด
- กลุ่มวิจัยความหลากหลายทางชีวภาพสัตว์น้ำจืด
- กลุ่มวิจัยการจัดการประมงน้ำจืด
- กลุ่มวิชาการ
- กลุ่มประเมินสภาวะทรัพยากรประมงและนิเวศแหล่งน้ำจืด
- กลุ่มบูรณะแหล่งน้ำเพื่อการประมง
- 21. กองวิจัยและพัฒนาพันธุกรรมสัตว์น้ำ
- กลุ่มวิชาการ กองวิจัยและพัฒนาพันธุกรรมสัตว์น้ำ
- กลุ่มวิจัยและพัฒนาธนาคารเชื้อพันธุ์
- กลุ่มวิจัยและพัฒนาพันธุกรรมโมเลกุล
- กลุ่มวิจัยและพัฒนาการปรับปรุงพันธุ์
- 22. กองวิจัยและพัฒนาสุขภาพสัตว์น้ำ
- 23. กองวิจัยและพัฒนาอาหารสัตว์น้ำ
- 24. ศูนย์เทคโนโลยีสารสนเทศและการสื่อสาร
- 25. สำนักงานประมงพื้นที่กรุงเทพมหานคร
- 26. กองควบคุมการประมงนอกน่านน้ำและการขนถ่ายสัตว์น้ำ
- 27. สำนักงานเลขานุการคณะกรรมการบริหารเงินทุนหมุนเวียนในการผลิตพันธุ์ปลา พันธุ์กุ้ง และพันธุ์สัตว์น้ำอื่นๆ
