- ศูนย์วิจัยและพัฒนาประมงอ่าวไทยตอนบน (สมุทรปราการ)
- ศูนย์วิจัยและพัฒนาประมงอ่าวไทยฝั่งตะวันออก (ระยอง) (เว็บใหม่)
- ศูนย์วิจัยและพัฒนาประมงอ่าวไทยตอนกลาง (ชุมพร) (เว็บใหม่)
- ศูนย์วิจัยและพัฒนาประมงอ่าวไทยตอนล่าง (สงขลา)
- ศูนย์วิจัยและพัฒนาประมงอันดามันตอนบน (ภูเก็ต)
- ศูนย์วิจัยและพัฒนาประมงอันดามันตอนล่าง (สตูล)
- ศูนย์วิจัยและพัฒนาประมงทะเลนราธิวาส
- สถานีวิจัยและพัฒนาประมงทะเลจังหวัดระนอง
- สถานีวิจัยและพัฒนาประมงทะเลจังหวัดสมุทรสงคราม